DEXOM in python
Implémentation en python de DEXOM, un outil d'inférence de réseaux métaboliques contextuels spécifiques à partir de données d'expression génique. Utilise des règles GPR pour connecter les gènes et les réactions, et offre plusieurs méthodes d'énumération pour générer des sous-réseaux optimaux.
Cas d'utilisation métiers
Cas d'utilisation fonctionnel
Organisation
- Centres de recherche régionaux de l'INRAE (organisation rattachée)
Outils utilisés
- NumPy : voir les initiatives de ses organisations qui l'ont aussi
- Python : voir les initiatives de ses organisations qui l'ont aussi
- scikit-learn : voir les initiatives de ses organisations qui l'ont aussi
- Matplotlib : voir les initiatives de ses organisations qui l'ont aussi
- Sphinx : voir les initiatives de ses organisations qui l'ont aussi
- SciPy : voir les initiatives de ses organisations qui l'ont aussi
- Read the Docs : voir les initiatives de ses organisations qui l'ont aussi
Description générée le mardi 19 mars 2024 à 20:04:55
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