FastQC est un outil d'analyse de données de séquençage haut débit. Il vise à fournir une méthode simple pour effectuer des contrôles qualité sur les données brutes issues de ces pipelines. Il propose un ensemble modulaire d'analyses qui permettent d'obtenir une première impression de la qualité des données et d'identifier rapidement d'éventuels problèmes avant d'entreprendre toute analyse plus poussée.