MAGATT

Notoriété 10 %

Le pipeline MAGATT est un outil développé pour transférer et annoter des gènes chez les Triticées en utilisant une approche de cartographie fine et des données de marqueurs. Il est basé sur Snakemake et permet de faciliter le processus d'annotation.

Dépôt de code

https://forgemia.inra.fr/umr-gdec/magatt (nouvelle fenêtre)2 étoiles

Cas d'utilisation métiers

Utilisation d'une approche de cartographie fine pour le transfert d'annotations GFF : rechercher des initiatives proches
Intégration de données de marqueurs pour améliorer la précision de l'annotation : rechercher des initiatives proches
Transfert et annotation de gènes chez les Triticées : rechercher des initiatives proches

Organisation

Administration centrale
- Gouvernement (Premier ministre et ministères)
  - Ministère de l’Agriculture, de l'Agro-alimentaire et de la Souveraineté alimentaire
    - Établissements d'enseignement et de recherche - Ministère chargé de l’Agriculture, de l'Agro-alimentaire et de la Souveraineté alimentaire
      - Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement - Paris
        Centres de recherche régionaux de l'INRAE (organisation rattachée)

Description générée le lundi 18 mars 2024 à 11:44:15

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