GenomAsm4pg

Notoriété 13 %

Un workflow Snakemake pour l'assemblage de génomes à des fins pangenomiques utilisant des données PacBio HiFi, avec préparation des données et scripts d'exécution.

Dépôt de code

https://forgemia.inra.fr/asm4pg/GenomAsm4pg (nouvelle fenêtre)3 étoiles

Cas d'utilisation métiers

Génération de rapports HTML avec statistiques d'assemblage : rechercher des initiatives proches
Assemblage automatique et reproductible de génomes à partir de données PacBio HiFi : rechercher des initiatives proches

Organisation

Administration centrale
- Gouvernement (Premier ministre et ministères)
  - Ministère de l’Agriculture, de l'Agro-alimentaire et de la Souveraineté alimentaire
    - Établissements d'enseignement et de recherche - Ministère chargé de l’Agriculture, de l'Agro-alimentaire et de la Souveraineté alimentaire
      - Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement - Paris
        Centres de recherche régionaux de l'INRAE (organisation rattachée)

Description générée le mardi 19 mars 2024 à 19:59:30

D'autres initiatives de la même organisation

osrm
github.com/riatelab/osrm
support-de-formation
forgemia.inra.fr/git-gitlab-paca/support-de-formation
gustave
github.com/InseeFr/gustave
metagWGS
forgemia.inra.fr/genotoul-bioinfo/metagwgs