Seqkit est un outil en ligne de commande open-source et multiplateforme permettant la manipulation rapide et efficace de fichiers FASTA/Q. Il offre une grande variété de fonctionnalités pour l'analyse de données génomiques, telles que la recherche et l'extraction de séquences spécifiques, le filtrage, le tri, le regroupement et la fusion de fichiers.