specifics_alignmarkers

Ce pipeline Nextflow vise à aligner des marqueurs sur un génome de référence et à fournir des statistiques sur l'alignement. Il peut prendre en entrée un fichier CSV, FASTA ou VCF de séquences de marqueurs.

Dépôt de code

https://forgemia.inra.fr/geapsi/pipeline/specifics_alignmarkers (nouvelle fenêtre)

Cas d'utilisation métiers

Alignement de marqueurs à un génome de référence : rechercher des initiatives proches
Fourniture de statistiques sur l'alignement des marqueurs : rechercher des initiatives proches

Organisation

Administration centrale
- Gouvernement (Premier ministre et ministères)
  - Ministère de l’Agriculture, de l'Agro-alimentaire et de la Souveraineté alimentaire
    - Établissements d'enseignement et de recherche - Ministère chargé de l’Agriculture, de l'Agro-alimentaire et de la Souveraineté alimentaire
      - Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement - Paris
        Centres de recherche régionaux de l'INRAE (organisation rattachée)

Outil utilisé

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Description générée le lundi 18 mars 2024 à 10:14:58

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