BIOPAX-Explorer est un package Python conçu pour faciliter la manipulation de jeux de données BIOPAX. Il exploite RDF et SPARQL en utilisant une syntaxe orientée objet et spécifique au domaine. Le modèle d'objet BIOPAX-Explorer suit la spécification complète de BIOPAX niveau 3, garantissant ainsi sa conformité grâce à une technique de génération de code (OWL vers Python) effectuée par le package rdfobject.