eval_data_integration_tools
L'atelier a pour objectif d'intégrer et d'analyser des données omiques hétérogènes via des approches statistiques en s'appuyant sur les packages R MOFA2 et mixOmics. Deux cas d'étude sont proposés, l'un sur des données métabolomiques et transcriptomiques de deux variétés de colzas soumises à un stress hydrique et parasitique, et l'autre sur des données RNAseq et metabarcoding (16S et 18S) d'une autre variété de colzas.
Cas d'utilisation métiers
- Analyse conjointe de données métabolomiques et transcriptomiques : rechercher des initiatives proches
- Analyse de données obtenues à différents points du développement de colzas soumises à un stress hydrique et parasitique : rechercher des initiatives proches
- Intégration et analyse de données omiques hétérogènes : rechercher des initiatives proches
Cas d'utilisation fonctionnel
Organisation
- Centres de recherche régionaux de l'INRAE (organisation rattachée)
Description générée le lundi 18 mars 2024 à 11:41:30
D'autres initiatives de la même organisation
- osrmgithub.com/riatelab/osrm
- support-de-formationforgemia.inra.fr/git-gitlab-paca/support-de-formation
- gustavegithub.com/InseeFr/gustave
- metagWGSforgemia.inra.fr/genotoul-bioinfo/metagwgs