ICEscreen est une pipeline bioinformatique permettant la détection et l'annotation d'ICEs (Integrative and Conjugative Elements) et d'IMEs (Integrative and Mobilizable Elements) dans des génomes de Bacillota. Il permet la détection de protéines signature d'ICEs et d'IMEs grâce à une recherche par similarité et la détection de protéines homologues distantes grâce à des profils HMM. Le pipeline groupe les protéines appartenant à la même structure ICE/IME et génère des tableaux récapitulatifs des ICEs et IMEs détectés.