ocmmed
OCMMED est un outil permettant l'obtention de modèles métaboliques cellulaires spécifiques grâce à l'énumération avec DEXOM. Il prend en entrée un réseau métabolique et des données transcriptomiques, et génère un modèle métabolique contextuel en maximisant les réactions actives avec des poids positifs et les réactions inactives avec des poids négatifs.
Cas d'utilisation métiers
- Génération de modèles métaboliques contextuels à partir de données d'expression : rechercher des initiatives proches
- Modélisation de réseaux métaboliques cellulaires spécifiques : rechercher des initiatives proches
- Analyse de données transcriptomiques pour contraindre les modèles métaboliques : rechercher des initiatives proches
Cas d'utilisation fonctionnel
Organisation
- Centres de recherche régionaux de l'INRAE (organisation rattachée)
Description générée le lundi 18 mars 2024 à 10:47:46
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