swim-infer

Code compagnon à la publication 'Inferring characteristics of bacterial swimming in biofilm matrix from time-lapse confocal laser scanning microscopy', Ravel et al. Il contient deux notebooks : le premier implémente des trajectoires de bactéries nageant dans un biofilm synthétique, infère les paramètres du modèle et compare les résultats avec les données synthétiques d'origine ; le second notebook reproduit le graphique 2 de l'article à partir des images post-traitées de microscopie.
Description générée le dimanche 17 mars 2024 à 19:55:40

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