samtools

Samtools est un ensemble d'outils pour la manipulation et l'analyse de données génomiques, en particulier pour les formats de fichiers SAM, BAM et CRAM. Il permet de visualiser, d'indexer et de trier ces fichiers, ainsi que de les convertir entre eux.

Dépôt de code

https://forgemia.inra.fr/gafl/singularity/samtools (nouvelle fenêtre)

Cas d'utilisation métiers

Travail avec les formats de fichiers SAM, BAM et CRAM : rechercher des initiatives proches
Analyse et manipulation de données génomiques : rechercher des initiatives proches

Organisation

Administration centrale
- Gouvernement (Premier ministre et ministères)
  - Ministère de l’Agriculture, de l'Agro-alimentaire et de la Souveraineté alimentaire
    - Établissements d'enseignement et de recherche - Ministère chargé de l’Agriculture, de l'Agro-alimentaire et de la Souveraineté alimentaire
      - Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement - Paris
        Centres de recherche régionaux de l'INRAE (organisation rattachée)

Description générée le lundi 18 mars 2024 à 00:50:31

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