AffiliationExplorer est un outil permettant de choisir entre différentes affiliations conflictuelles pour des données taxonomiques. Il prend en entrée deux fichiers : un fichier biom et un fichier de multi-hits, et trie les taxons multi-affiliés par ordre décroissant d'abondance. L'utilisateur peut alors sélectionner une (ou aucune) des affiliations conflictuelles, ou éditer manuellement l'affiliation. Le fichier biom corrigé peut être téléchargé et utilisé avec la fonction import_frogs() du package phyloseq-extended.