Annuaire des initiatives
Pertinence
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- Centres de recherche régionaux de l'INRAE
- Génère des feuilles de calcul
- Notoriété 10 %Ce projet vise à analyser des séquences génomiques de micro-organismes à l'aide de méthodes de métabarcoding haute fidélité. Il permet d'identifier les taxons bactériens présents dans un échantillon et d'étudier la diversité microbienne. Le projet est basé sur l'utilisation de l'outil FROGS et de méthodes d'analyse statistique.
- Notoriété 7 %ICEscreen est une pipeline bioinformatique permettant la détection et l'annotation d'ICEs (Integrative and Conjugative Elements) et d'IMEs (Integrative and Mobilizable Elements) dans des génomes de Bacillota. Il permet la détection de protéines signature d'ICEs et d'IMEs grâce à une recherche par similarité et la détection de protéines homologues distantes grâce à des profils HMM. Le pipeline groupe les protéines appartenant à la même structure ICE/IME et génère des tableaux récapitulatifs des ICEs et IMEs détectés.
- Ce projet fournit des scripts permettant de manipuler et post-traiter des données d'Eddy covariance, une méthode de mesure des flux de gaz dans l'atmosphère. Il permet aux scientifiques de l'environnement de traiter et analyser des données de mesure pour une meilleure compréhension des phénomènes environnementaux.
26 initiatives
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