Annuaire des initiatives
Pertinence
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- Institut français de recherche pour l'exploitation de la mer
- Possède un système de recherche
- L’Ifremer est un institut public français dédié à la recherche, l’innovation et l’expertise en sciences marines. Il œuvre pour protéger et restaurer les écosystèmes océaniques, exploiter durablement les ressources marines, et partager les connaissances et données sur l’océan. L’institut contribue également à l’appui aux politiques publiques et à la médiation scientifique pour sensibiliser la société aux enjeux océaniques.
- OMICS-CATALOG est un outil basé sur un pipeline Nextflow qui implémente une session de navigateur de génomes pour visualiser les données omiques et met en place un catalogue interactif de génomes basé sur l'outil de visualisation de données Keshif. Le catalogue fournit la liste des organismes modèles disponibles, ainsi que les métadonnées telles que la lignée, la version du génome, le soumetteur, etc. Pour visualiser les données omiques des organismes modèles, le catalogue donne accès à la session du navigateur de génomes, qui est implémentée en utilisant le visualiseur JBrowse2.
- ToolDirectory est un outil permettant d'afficher de manière conviviale une liste de logiciels dans une page web, avec des capacités de filtrage de données dynamiques. Il utilise le visualiseur Katalog pour l'affichage web, qui nécessite simplement un fichier '.csv' contenant les métadonnées des logiciels à utiliser pour la visualisation.
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