Le Portail Calcul-Stockage-Cloud est un outil communautaire d’aide aux scientifiques pour simplifier le paysage des offres de ressources de calcul, de stockage et de cloud, et proposer une documentation adaptée aux débutants.

D-GENIES est un outil d'analyse de génomes permettant la comparaison de séquences et la visualisation d'alignements de génomes entiers. Il est basé sur le logiciel minimap2 et offre une interface interactive pour zoomer et télécharger différents fichiers d'image, d'alignement ou de séquences. D-GENIES est open source et disponible en installation locale.

BiSePSGUI est une application de bureau permettant d'analyser des données de séquençage de bisulfite entier de génome. Il s'agit d'une application Mongodb/express/React/Nodejs bundlée avec webpack et empaquetée dans une application de bureau à l'aide d'Electron. Il exécute un pipeline snakemake localement ou sur des machines distantes via des informations d'identification ssh. Il dépend de git et de Conda pour la gestion des workflows et des dépendances. Il prend en charge l'exécution sur des clusters SLURM.

Easy16S est une application web interactive conçue pour faciliter l'exploration, la visualisation et l'analyse de données de microbiome. Elle est construite sur le package R phyloseq et ses extensions, et est intégrée à la suite de traitement de séquences FROGS.

Le projet modvege-r est une plateforme dédiée à la gestion et au suivi des demandes d'intervention pour le bien-être animal. Il permet de centraliser les informations sur les animaux en détresse, de coordonner les équipes d'intervention et de suivre l'état d'avancement des opérations.

Thaliadb est une plateforme dédiée à la gestion, l'analyse et la visualisation de données de recherche en biologie, en particulier dans le domaine de la génomique. Elle offre des fonctionnalités avancées pour l'exploration et l'interprétation des données, ainsi que des outils de collaboration pour faciliter le travail en équipe.

Ce projet permet de faciliter le transfert de fichiers vers la plateforme Dataverse en gérant les métadonnées associées et en assurant le suivi de l'état des transferts.

Le connecteur de transfert de données Dataverse-JupyterHub est un outil de démonstration conçu pour faciliter le transfert de données entre un dépôt Dataverse et une plateforme d'analyse basée sur le cloud telle que JupyterHub. Ce connecteur, développé dans le cadre du projet EOSC Pillar, explore les possibilités d'interopérabilité des données au sein de l'infrastructure européenne du cloud ouvert de science (EOSC).

Le projet po2manager est une application dédiée à la gestion de données ontologiques. Il permet la création, l'édition et la validation de concepts et propriétés selon le standard SHACL. L'importation et l'exportation de données sont également possibles dans différents formats.

SHiNeMaS est une base de données avec son interface web, dédiée à la gestion de l'historique des lots de semences et des données associées telles que le phénotypage, l'environnement et les pratiques culturales. SHiNeMaS est disponible sous licence GNU Affero GPL.