Le projet pgd-mmdt est un outil de gestion de métadonnées dédié aux espaces de stockage de données. Il permet de rechercher des termes à partir de sources externes et de créer des formulaires personnalisés pour la collecte de métadonnées.

ODAM est un système de gestion de tables de données expérimentales qui offre un accès ouvert et facilite l'exploration, la préparation et l'analyse des données. Il est conçu pour gérer et organiser les données de manière à les rendre facilement accessibles, interopérables et réutilisables.

Le projet jupyterhub-vm permet de construire et de configurer des machines virtuelles à partir d'une image ISO de serveur Ubuntu, en utilisant les outils Packer, Vagrant et Ansible. Il est possible d'utiliser ces machines virtuelles avec VirtualBox ou OpenStack. Le projet est particulièrement utile pour les chercheurs et les développeurs qui ont besoin d'un environnement dédié pour l'analyse de données et le développement de notebooks Jupyter.

Le Portail Calcul-Stockage-Cloud est un outil communautaire d’aide aux scientifiques pour simplifier le paysage des offres de ressources de calcul, de stockage et de cloud, et proposer une documentation adaptée aux débutants.

D-GENIES est un outil d'analyse de génomes permettant la comparaison de séquences et la visualisation d'alignements de génomes entiers. Il est basé sur le logiciel minimap2 et offre une interface interactive pour zoomer et télécharger différents fichiers d'image, d'alignement ou de séquences. D-GENIES est open source et disponible en installation locale.

BiSePSGUI est une application de bureau permettant d'analyser des données de séquençage de bisulfite entier de génome. Il s'agit d'une application Mongodb/express/React/Nodejs bundlée avec webpack et empaquetée dans une application de bureau à l'aide d'Electron. Il exécute un pipeline snakemake localement ou sur des machines distantes via des informations d'identification ssh. Il dépend de git et de Conda pour la gestion des workflows et des dépendances. Il prend en charge l'exécution sur des clusters SLURM.

Easy16S est une application web interactive conçue pour faciliter l'exploration, la visualisation et l'analyse de données de microbiome. Elle est construite sur le package R phyloseq et ses extensions, et est intégrée à la suite de traitement de séquences FROGS.

Le projet modvege-r est une plateforme dédiée à la gestion et au suivi des demandes d'intervention pour le bien-être animal. Il permet de centraliser les informations sur les animaux en détresse, de coordonner les équipes d'intervention et de suivre l'état d'avancement des opérations.

This PHP application is designed to read and process data generated by ODK Collect. It provides functionalities for file management, data sanitization, and data export in various formats. It also includes features for debugging and logging.

Thaliadb est une plateforme dédiée à la gestion, l'analyse et la visualisation de données de recherche en biologie, en particulier dans le domaine de la génomique. Elle offre des fonctionnalités avancées pour l'exploration et l'interprétation des données, ainsi que des outils de collaboration pour faciliter le travail en équipe.