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  • Institut de recherche pour le développement
  • PyTorch
  • Ce projet vise à comparer plusieurs outils permettant d'identifier les cytosines méthylées dans des données fast5. Après avoir exécuté ces outils sur un jeu de données test d'Arabidopsis thaliana, une analyse comparative a été réalisée en termes de détection par sites. Il a été conclu que DeepSignalPlant était le plus performant. Ce dépôt contient des scripts permettant d'exécuter DeepSignalPlant et de générer des statistiques à partir de ses résultats.

1 initiative