Ce projet est une initiation à Git, un système de contrôle de version décentralisé. Il permet aux utilisateurs d'apprendre les bases de Git, de gérer leurs versions de code source et de collaborer avec d'autres développeurs. Le projet est intégré à GitLab pour offrir des fonctionnalités avancées telles que la gestion de projets, le suivi des problèmes et le déploiement continu.

BiSePSGUI est une application de bureau permettant d'analyser des données de séquençage de bisulfite entier de génome. Il s'agit d'une application Mongodb/express/React/Nodejs bundlée avec webpack et empaquetée dans une application de bureau à l'aide d'Electron. Il exécute un pipeline snakemake localement ou sur des machines distantes via des informations d'identification ssh. Il dépend de git et de Conda pour la gestion des workflows et des dépendances. Il prend en charge l'exécution sur des clusters SLURM.

Thaliadb est une plateforme dédiée à la gestion, l'analyse et la visualisation de données de recherche en biologie, en particulier dans le domaine de la génomique. Elle offre des fonctionnalités avancées pour l'exploration et l'interprétation des données, ainsi que des outils de collaboration pour faciliter le travail en équipe.

Ce projet vise à gérer, analyser et visualiser les données d'inventaire forestier de long terme provenant de parcelles de montagne en France. Il fournit des fonctionnalités pour nettoyer, structurer et mettre en forme les données, ainsi que pour générer des graphiques et tableaux pour des publications scientifiques. Le projet met également à disposition les données et le code pour permettre la reproductibilité des résultats.

Le projet dbeel vise à faciliter l'intégration et la gestion des données de DAMs (Dépôts d'Archives Multimédias) et d'électrofishage. Il offre des scripts et des outils pour automatiser les workflows de gestion des données et améliorer l'interopérabilité entre les différentes sources de données.

Le projet esfc est une application web dédiée à la gestion et l'analyse de données piscicoles. Il permet de saisir, stocker et analyser des informations sur les poissons, leurs caractéristiques, leur croissance et les campagnes de pêche. Il offre des fonctionnalités de visualisation de données, de calcul de statistiques et de génération de rapports.

Ce projet fournit des ressources pour l'apprentissage du langage de programmation R, y compris des PDF de présentation, des scripts avec exercices corrigés et un GuideLine pour les bonnes pratiques de codage.

Le projet irrig est une ontologie spécifique dédiée à l'expérimentation en irrigation à Irstea, centre de Clermont Ferrand. Il fournit des données et des informations essentielles pour soutenir l'expérimentation dans ce domaine.

The Istex project is a parser for Istex exports designed for use with Cortext Manager. It provides a way to map the Istex format to the Cortext Manager format, making it easier to work with the data from Istex exports. The project extracts and organizes the data from the exports, including the original PDF and XML files from the editor.

Le projet SiriusQuality-BioMa-Phenology-Component est dédié à la modélisation de la phénologie des écosystèmes dans le cadre du projet SiriusQuality2. Il permet la surveillance et l'analyse de la biodiversité des espèces végétales, ainsi que la prévision des effets du changement climatique sur la végétation.