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Pertinence
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- Karyoplot est un package python permettant de dessiner des karyoplots/idéogrammes simples à partir de fichiers de données cytogénétiques conventionnels (tels que .bed, .fasta, .gff, .gtf, .vcf, etc.) sans avoir besoin de manipulations de fichiers préalables. Il est basé sur matplotlib pour le rendu des graphiques et pysam pour l'analyse des formats de fichiers bioinformatiques.
- Seqkit est un outil en ligne de commande open-source et multiplateforme permettant la manipulation rapide et efficace de fichiers FASTA/Q. Il offre une grande variété de fonctionnalités pour l'analyse de données génomiques, telles que la recherche et l'extraction de séquences spécifiques, le filtrage, le tri, le regroupement et la fusion de fichiers.
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