Ce projet vise à analyser et prédire les troubles neurodéveloppementaux à partir de données d'imagerie cérébrale. Il combine les données de deux ensembles de données prétraitées avec FreeSurfer : Autism Brain Imaging Data Exchange (ABIDE) et Attention Deficit Hyperactivity Disorder (ADHD-200). Le projet utilise des techniques d'apprentissage automatique pour indiquer les troubles neurodéveloppementaux dans la fonctionnalité fx.

Le projet WatershedWPS est un service de calcul de bassins versants en tout point du territoire français. Il offre la possibilité de calculer un bassin versant en utilisant différentes configurations préparées, chacune correspondant à un choix de données d'entrées et de paramétrage d'algorithmes aux différentes étapes du prétraitement. Le service est composé principalement d'un service OGC:WPS offrant les méthodes de description des capacités, de calcul et de récupération des bassins versants, ainsi que d'un lot de services annexes facilitant son utilisation, tels qu'un service OGC:WMS des données prétraitées.

Ce projet propose un pipeline de traitement de données RNA-Seq pour passer des données brutes FASTQ à une table de comptage de gènes. Il inclut des étapes de prétraitement, de contrôle qualité, de mapping, de quantification et de détection de variants génétiques.

Pathways est un système d'exploration de chemins d'entités qui permet d'afficher l'ensemble des connexions entre deux types d'entités, telles que des personnes, des lieux, des organisations, des adresses électroniques, etc. Il a été développé sur la base du projet Abstra et est organisé en différents modules : le cœur du système, les jeux de données utilisés dans la section des expériences, les scripts utilisés pour la section des expériences et les scripts Python utilisés pour le prétraitement des données et l'extraction d'entités nommées.

Ce projet utilise des données agrégées du système d'information sur la vaccination et des données brutes de l'enquête Covid-ESMS de Santé Publique France pour produire des chiffres et des illustrations sur la vaccination contre la Covid-19 en Ehpad et son effet sur la contamination des résidents. Il inclut des scripts de prétraitement des données, de génération de graphiques et de calcul des taux de vaccination.

FFQ est un outil conçu pour fournir un prétraitement de fichiers FASTQ. Il est développé en C++ et permet de gérer et filtrer des données de séquençage à haut débit.

Methylome est un workflow FAIR optimisé pour l'étude du méthylome des génomes de poisson, utilisant Nexflow dsl2, Singularity et Slurm. Il permet le prétraitement de données de séquençage à haut débit, l'alignement, la suppression des duplicats et l'appel de méthylation, grâce à Trim Galore, Bismark et bedGraphToBigWig.

Le projet gimbal_controller_management est dédié au contrôle et à la gestion de gimbals, ainsi qu'à la publication, au prétraitement et à la visualisation des données de capteurs. Il est composé de plusieurs packages ROS (Robot Operating System) travaillant ensemble pour fournir une solution complète de gestion de gimbals et de données de capteurs.

Ce projet est une collection d'algorithmes, de visualisations et d'outils pour le traitement de signaux biomédicaux, en particulier pour l'analyse de données EEG et la création d'interfaces cerveau-ordinateur. Il inclut des fonctionnalités telles que le prétraitement de signaux, la détection de caractéristiques, la classification et la visualisation de données en temps réel.

Le projet mod_sharedspaceh permet la gestion d'instances partagées, la configuration de paramètres et le prétraitement de données. Il offre des fonctionnalités dédiées à la manipulation et à la configuration d'espaces partagés, ainsi qu'à la préparation de données pour un traitement ultérieur.