Pipeline d'analyse dédié au séquençage d'exomes, permettant de traiter des données de lecture génomique pour identifier et annoter des variants. Il automatise les étapes clés comme l'alignement des séquences, la détection de mutations et l'annotation fonctionnelle, facilitant ainsi l'interprétation des données génomiques pour des applications en recherche médicale ou en génétique clinique.

Site dédié à la publication et à la diffusion de recherches scientifiques dans le domaine de la biologie et de la médecine. Il propose des articles spécialisés sur des mécanismes moléculaires, des récepteurs, des enzymes et des études expérimentales, principalement axés sur des sujets comme le cancer du sein, les thérapies géniques et les analyses génétiques. Le contenu est rédigé par des chercheurs et vise à partager des avancées scientifiques avec la communauté médicale et scientifique.

Ce projet explore l'intégration de l'intelligence artificielle dans le domaine médical pour améliorer les diagnostics, optimiser les traitements et accélérer la recherche. Il couvre des applications comme l'analyse automatisée d'images médicales (radiographies, IRM), l'assistance aux chirurgiens via des robots, et la personnalisation des soins en fonction des données génétiques ou des antécédents des patients. L'objectif est de rendre la médecine plus précise, rapide et adaptée aux besoins individuels.

Outil dédié à l'appel de variants génétiques à partir de données de séquençage haut débit. Il permet d'identifier les polymorphismes nucléotidiques (SNPs) et les insertions/délétions (indels) dans des génomes de référence. Utilisé principalement en génomique humaine, végétale et microbienne, il génère des données exploitables pour la recherche médicale, l'amélioration des cultures ou l'étude de la biodiversité.

GAZODUC est un pipeline bioinformatique développé pour l'analyse de données génomiques, notamment utilisé à l'Institut du Thorax à Nantes. Il permet de traiter des séquences génomiques en utilisant des outils comme Nextflow pour automatiser des workflows complexes. Le projet facilite la gestion de données issues de séquençage haut débit et génère des résultats exploitables pour la recherche médicale et génétique.

Outil de pipeline bioinformatique dédié à l'analyse des variants génétiques rares et de fréquence intermédiaire, particulièrement adapté aux maladies cardiaques comme le syndrome de Brugada. Il permet d'effectuer des tests d'association sur des régions codantes (par exon ou isoformes) et régulatrices (fournies via un fichier BED). Le pipeline intègre des fonctionnalités pour traiter des données VCF et génère des résultats exploitables pour la recherche médicale.