Outil d'aide au diagnostic trafic développé par le Cerema Centre-Est pour évaluer la faisabilité de voies réservées au covoiturage. Il permet d'analyser des indicateurs basés sur des données de stations de comptage (SIREDO) et de visualiser ces informations via un tableau de bord interactif sous RShiny. L'application facilite la prise de décision pour les études de préfaisabilité et la planification des infrastructures routières.

Outil dédié à l'analyse et au traitement de données taxonomiques virales issues de résultats BLAST et de tables de comptage. Il permet de filtrer, regrouper et fusionner des données pour préparer des analyses en aval comme la visualisation ou les tests statistiques. Basé sur des algorithmes de propagation de labels et de clustering, il identifie des groupes de contigs viraux partageant des profils similaires.

MorseDR est une bibliothèque R dédiée à l'évaluation quantitative des risques environnementaux. Elle permet d'analyser des données écotoxicologiques (binaires, comptages ou continues) via des méthodes bayésiennes. L'outil facilite la modélisation de la réponse aux doses de substances chimiques, la visualisation des données et des résultats, ainsi que l'estimation des incertitudes. Il est particulièrement utile pour les chercheurs et régulateurs en toxicologie environnementale.

MorseTKTD est une bibliothèque R dédiée à l'évaluation quantitative des risques environnementaux. Elle permet d'appliquer des méthodes avancées d'inférence bayésienne pour modéliser la survie d'organismes exposés à des substances toxiques. Le projet intègre des outils pour analyser des données binaires, de comptage ou continues, et propose des fonctionnalités de visualisation et de simulation pour faciliter l'interprétation des résultats.

Ce projet permet d'identifier et de quantifier les bactéries présentes dans le microbiote de souris issues de la lignée OligoMM12, élevée dans les animaleries de l'Institut Pasteur. Il génère des fichiers de comptage, d'annotation et des visualisations interactives (Krona) pour analyser les proportions relatives des bactéries. Les données sont traitées via un workflow automatisé, disponible sur Galaxy et en ligne de commande, facilitant l'analyse métagénomique pour la recherche biomédicale.

Ensemble d'outils pour l'analyse des données métaprotéomiques générées par des instruments de spectrométrie de masse de haute throughput. Ces outils permettent de regrouper les abondances de peptides et protéines, exprimées en comptages spectraux, et de les manipuler en groupes de métaprotéines. Les informations obtenues peuvent être représentées à l'aide de fonctions de visualisation multiples pour afficher le paysage métaprotéomique global et différencier les échantillons ou conditions en termes d'abondance de métaprotéines, de niveaux taxonomiques et/ou d'annotation fonctionnelle.

Plateforme RShiny de diagnostic trafic permettant la visualisation et l'analyse de données de comptages routiers dans le cadre d'études de préfaisabilité de voies réservées au covoiturage.

Ce projet permet d'analyser et de visualiser des données météorologiques et environnementales liées aux risques d'incendie de forêt en Algérie. Il exploite un jeu de données détaillé incluant température, humidité, vitesse du vent et précipitations pour évaluer les conditions propices aux départs de feu. Les utilisateurs peuvent explorer ces données pour mieux comprendre les facteurs influençant les incendies et contribuer à leur prévention.