Ce projet vise à analyser des séquences génomiques de micro-organismes à l'aide de méthodes de métabarcoding haute fidélité. Il permet d'identifier les taxons bactériens présents dans un échantillon et d'étudier la diversité microbienne. Le projet est basé sur l'utilisation de l'outil FROGS et de méthodes d'analyse statistique.

CLARI-TE_smk est un pipeline Snakemake pour l'annotation génomique à grande échelle de TEs de génomes *Triticeae* basé sur RepeatMasker et CLARI-TE. Il est conçu pour fonctionner sur un cluster HPC avec slurm et effectue des calculs distribués pour annoter simultanément les TEs de différents chromosomes d'un génome. Il crée finalement un fichier d'annotation gff3.

Le projet dbeel vise à faciliter l'intégration et la gestion des données de DAMs (Dépôts d'Archives Multimédias) et d'électrofishage. Il offre des scripts et des outils pour automatiser les workflows de gestion des données et améliorer l'interopérabilité entre les différentes sources de données.

Le projet omnicrobe-database vise à gérer et intégrer des données microbiennes, en particulier les données de séquençage. Il offre des fonctionnalités d'analyse de données génomiques et permet de stocker et organiser les données dans une base de données relationnelle.

Le projet SiriusQuality-BioMa-Phenology-Component est dédié à la modélisation de la phénologie des écosystèmes dans le cadre du projet SiriusQuality2. Il permet la surveillance et l'analyse de la biodiversité des espèces végétales, ainsi que la prévision des effets du changement climatique sur la végétation.

Ce projet est un module de Sirius Quality dédié à l'évaluation de la teneur en biomasse des cultures de blé et au calcul de l'indice de surface foliaire (LAI) en utilisant des techniques de traitement d'images et d'apprentissage automatique. Il fournit des données précieuses pour l'évaluation de la productivité du blé.

Ce projet fournit des scripts permettant d'effectuer des analyses de flux de variabilité sur un modèle de réseau métabolique humain, et de créer des représentations graphiques des résultats.

Acoustic GUI est une interface graphique Java permettant de lancer un programme Python d'analyse acoustique de vidéos de poissons. Il permet de visualiser les données acoustiques et de suivre les populations de poissons.

Ansys-mesolr est un projet dédié à la simulation de mécanique des fluides et à l'analyse de données scientifiques. Il permet de créer des modèles numériques précis et détaillés, offrant ainsi la possibilité de tester et d'optimiser des designs dans un large éventail d'applications industrielles.

BIOPAX-Explorer est un package Python conçu pour faciliter la manipulation de jeux de données BIOPAX. Il exploite RDF et SPARQL en utilisant une syntaxe orientée objet et spécifique au domaine. Le modèle d'objet BIOPAX-Explorer suit la spécification complète de BIOPAX niveau 3, garantissant ainsi sa conformité grâce à une technique de génération de code (OWL vers Python) effectuée par le package rdfobject.