Ce projet est un ensemble de notebooks pour la création d'une application Shiny sur l'artificialisation, réalisés à l'occasion du Mois de l'Innovation Publique 2021. Il contient des noteboks pour l'introduction, la lecture des données de flux, la récupération des stats de flux, la création de différents types de graphiques avec ggplot, la réalisation d'une requête spatiale, et la réflexion sur la dataviz.

Ce projet propose un diaporama interactif conçu pour présenter les outils de géomatique sous R et les notebooks comme support de science reproductible. Il vise à sensibiliser les participants aux bonnes pratiques de publication et de collaboration en utilisant des formats ouverts et accessibles.

Ce projet développe un modèle d'optimisation pour concevoir des réseaux de vélos en libre-service intégrés aux transports publics. Il détermine l'emplacement des stations, leur capacité et le nombre de vélos initiaux, afin de maximiser la couverture de la demande de mobilité (trajets directs ou combinés avec les transports publics) sous contraintes budgétaires. Les résultats sont visualisés via une interface interactive et des notebooks analytiques.

Ce dépôt contient un bookdown des bonnes pratiques de développement pour les projets de type PROPRE, qui suit le PROcessus de Publications REproductibles et est conduit par une équipe pluri-disciplinaire. Il propose des accès facilités aux données brutes, agrégées et analysées produites et les diffuse en favorisant la réussite des projets grâce à des méthodes modernes de développement et l'utilisation d'outils libres et open-source.

Projet fournissant des notebooks Jupyter dédiés à la résolution de défis lancés par data.gouv.fr, la plateforme française de données publiques. Ces notebooks permettent aux utilisateurs d'analyser, visualiser et traiter des jeux de données gouvernementaux pour répondre à des problématiques spécifiques ou contribuer à l'innovation publique.

Code compagnon à la publication 'Inferring characteristics of bacterial swimming in biofilm matrix from time-lapse confocal laser scanning microscopy', Ravel et al. Il contient deux notebooks : le premier implémente des trajectoires de bactéries nageant dans un biofilm synthétique, infère les paramètres du modèle et compare les résultats avec les données synthétiques d'origine ; le second notebook reproduit le graphique 2 de l'article à partir des images post-traitées de microscopie.

Ce projet propose des notebooks interactifs accompagnant un document méthodologique de l'Insee sur les méthodes ensemblistes appliquées à la statistique publique. Il facilite la compréhension et la mise en œuvre de ces méthodes à travers des cas concrets utilisant des données publiques accessibles librement. Les exemples couvrent notamment la classification binaire et la régression avec des forêts aléatoires.

Projet de recherche financé par la région Nouvelle-Aquitaine, associant plusieurs laboratoires universitaires. Il vise à analyser les migrations humaines et leurs impacts sur les territoires à travers des outils de visualisation et de modélisation. Les données sont traitées via des scripts et des notebooks pour produire des analyses géographiques et des publications scientifiques.

Ce projet vise à évaluer la variabilité analytique dans les analyses de neuroimagerie fonctionnelle (fMRI) à grande échelle. Il explore différentes configurations de pipelines de traitement d'images cérébrales pour identifier les sources de variabilité dans les résultats. Les données proviennent de sujets de l'Human Connectome Project et sont analysées via des notebooks Jupyter. Les résultats sont présentés sous forme de graphiques et de figures pour une publication scientifique lors du congrès OHBM 2026.

Ce projet propose un ensemble de tutoriels interactifs sous forme de notebooks Jupyter pour initier les utilisateurs à l'imagerie par diffraction cohérente (ptychographie). Destiné à un public académique et étudiant, il couvre des concepts de physique expérimentale et des méthodes de reconstruction d'images à partir de données de diffraction. Les notebooks, inspirés de travaux existants, sont conçus pour un usage pédagogique et non pour des applications industrielles.